БИОИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ CRISPR/CAS СИСТЕМЫ ШТАММА YERSINIAPSEUDOTUBERCULOSIS IP32953
Рубрики: НОВЫЕ ТЕХНОЛОГИИ
Авторы:
2.
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
(Лаборатория молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, лаборант-исследователь)
Иркутск, Иркутская область, Россия
Иркутск, Иркутская область, Россия
8.
Иркутский государственный медицинский университет
(кафедра микробиологии, вирусологии и иммунологии с курсом клинической лабораторной диагностики, Заведующий)
Иркутск, Иркутская область, Россия
Иркутск, Иркутская область, Россия
Тип:
Статья
Страницы:
с 64
по 67
Статус:
Опубликован
Получено:
09.12.2016
Одобрено:
09.12.2016
Опубликовано:
09.12.2016
Язык материала:
русский
Ключевые слова:
CRISPR/Cas, иерсинии, биоинформатика
Аннотация (русский):
Цель данного исследования: поиск и расшифровка CRISPR/Cas системы с помощью пакета программ в геноме Y.pseudotuberculosis IP32953. С помощью объединения результатов 4программных методов мы обнаружили в геноме штамма Y.pseudotuberculosis IP329353 один набор cas-генов и три локуса: YP1, YP2 и YP3. Через спейсеры кассет были обнаружены протоспейсеры в геномах: Y.pseudotuberculosis, Y.intermedia, Y.similis, Salmonella phage, Enterobacteria phage, и плазмиды Y.pseudotuberculosis IP32953 и Y.pseudotuberculosis IP31758.
Цель данного исследования: поиск и расшифровка CRISPR/Cas системы с помощью пакета программ в геноме Y.pseudotuberculosis IP32953. С помощью объединения результатов 4программных методов мы обнаружили в геноме штамма Y.pseudotuberculosis IP329353 один набор cas-генов и три локуса: YP1, YP2 и YP3. Через спейсеры кассет были обнаружены протоспейсеры в геномах: Y.pseudotuberculosis, Y.intermedia, Y.similis, Salmonella phage, Enterobacteria phage, и плазмиды Y.pseudotuberculosis IP32953 и Y.pseudotuberculosis IP31758.
Ключевые слова:
CRISPR/Cas, иерсинии, биоинформатика
CRISPR/Cas, иерсинии, биоинформатика
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
