Целью статьи является исследование с системных позиций разноуровневых аспектов реализации научно-технологического потенциала российской экономики. Авторы исходят из гипотезы о том, что низкая конкурентоспособность российской экономики предопределяется профилем ее инновационной системы. Исследование динамики затрат на инновационную деятельность и анализ причин продолжающегося снижения инновационной активности приводят к выводу, что экономическая деятельность на каждом уровне только тогда будет детерминантой инновационного механизма развития, когда она направлена на создание и внедрение новых разработок с целью получения более высоких доходов по сравнению с теми, которые обеспечивали разработки для внедрения инноваций. Подчеркивается, что экономическая политика, ориентированная на наращивании национальных конкурентных преимуществ, неотделима от создания национальной инновационной системы. Приводятся пути влияния инновационной деятельности на решение социальных и экономических проблем. Формулируются основные факторы, которые в контексте развития экспортного потенциала и повышения конкурентоспособности позволят решить проблему собственных средств предприятий за счет внутреннего и внешнего рынков. Оценивается значение экспорта для перехода к фазе активных структурных преобразований. Делается вывод, что при формировании национальной инновационной системы требуется сбалансированность разноуровневых взаимодействий, встроенных в каркас государство-отрасль-регион-предприятие.