<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article
PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.4 20190208//EN"
       "JATS-journalpublishing1.dtd">
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en">
 <front>
  <journal-meta>
   <journal-id journal-id-type="publisher-id">Forestry Engineering Journal</journal-id>
   <journal-title-group>
    <journal-title xml:lang="en">Forestry Engineering Journal</journal-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Лесотехнический журнал</trans-title>
    </trans-title-group>
   </journal-title-group>
   <issn publication-format="print">2222-7962</issn>
  </journal-meta>
  <article-meta>
   <article-id pub-id-type="publisher-id">24304</article-id>
   <article-id pub-id-type="doi">10.12737/article_5c1a3206dad755.50307403</article-id>
   <article-categories>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru">
     <subject>Естественные науки и лес</subject>
    </subj-group>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en">
     <subject>NATURAL SCIENCES AND FOREST</subject>
    </subj-group>
    <subj-group>
     <subject>Естественные науки и лес</subject>
    </subj-group>
   </article-categories>
   <title-group>
    <article-title xml:lang="en">MOLECULAR IDENTIFICATION OF AZOTPIXING BACTERIA AZOSPIRILLUM</article-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>МОЛЕКУЛЯРНАЯ ИДЕНТИФИКАЦИЯ АЗОТФИКСИРУЮЩИХ БАКТЕРИЙ AZOSPIRILLUM</trans-title>
    </trans-title-group>
   </title-group>
   <contrib-group content-type="authors">
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Налбандян</surname>
       <given-names>Арпине Артаваздовна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Nalbandyan</surname>
       <given-names>Arpine Artavazdovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>arpnal@rambler.ru</email>
     <bio xml:lang="ru">
      <p>кандидат биологических наук;</p>
     </bio>
     <bio xml:lang="en">
      <p>candidate of sciences in biology;</p>
     </bio>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-1"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Безлер</surname>
       <given-names>Надежда Викторовна</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Bezler</surname>
       <given-names>Nadezhda Viktorovna</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-2"/>
    </contrib>
   </contrib-group>
   <aff-alternatives id="aff-1">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">ФГБНУ ВНИИСС им. А.Л. Мазлумова</institution>
     <city>Воронеж</city>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">ФГБНУ ВНИИСС им. А.Л. Мазлумова</institution>
     <city>Воронеж</city>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-2">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">ФГБНУ «Всероссийский НИИ сахарной свёклы и сахара имени А.Л. Мазлумова»</institution>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">ФГБНУ «Всероссийский НИИ сахарной свёклы и сахара имени А.Л. Мазлумова»</institution>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <volume>8</volume>
   <issue>4</issue>
   <fpage>19</fpage>
   <lpage>22</lpage>
   <self-uri xlink:href="https://naukaru.ru/en/nauka/article/24304/view">https://naukaru.ru/en/nauka/article/24304/view</self-uri>
   <abstract xml:lang="ru">
    <p>Целью работы являлось апробирование и подбор родо-специфических пар праймеров для достоверной идентификации азотфиксирующих микроорганизмов – грамотрицательных бактерий рода Azospirillum. В ходе работы была модифицирована методика экстракции суммарной ДНК изолятов бактерий из их биомассы – чистой культуры. Проводились экспериментальные исследования по подбору родо-специфического молекулярного маркера для надежной идентификации. Были оптимизированы и условия проведения полимеразно-цепной реакции (ПЦР). Амплификация суммарной ДНК бактерий с праймером Az16S-A F / Az16S-A R выявила у всех изучаемых номеров наличие ампликона размером в 640 п. н., что подтверждает принадлежность всех трех исследуемых образцов к роду Azospirillum. В результате проведенных экспериментов апробирован и отобран родо-специфический праймер Az16S-A F / Az16S-A R, позволивший выделить штаммы рода Azospirillum в чистой культуре (3 штамма). Полученные экспериментальные данные по молекулярному маркеру позволяют образцам штаммов, принадлежность которых к данному роду подтверждена ПЦР анализом, служить как положительным, так и отрицательным контролем при дальнейшей работе с бактериями.&#13;
Ключевые слова: ДНК, полимеразно-цепная реакция, праймер, бактерии, Azospirillum</p>
   </abstract>
   <trans-abstract xml:lang="en">
    <p>Целью работы являлось апробирование и подбор родо-специфических пар праймеров для достоверной идентификации азотфиксирующих микроорганизмов – грамотрицательных бактерий рода Azospirillum. В ходе работы была модифицирована методика экстракции суммарной ДНК изолятов бактерий из их биомассы – чистой культуры. Проводились экспериментальные исследования по подбору родо-специфического молекулярного маркера для надежной идентификации. Были оптимизированы и условия проведения полимеразно-цепной реакции (ПЦР). Амплификация суммарной ДНК бактерий с праймером Az16S-A F / Az16S-A R выявила у всех изучаемых номеров наличие ампликона размером в 640 п. н., что подтверждает принадлежность всех трех исследуемых образцов к роду Azospirillum. В результате проведенных экспериментов апробирован и отобран родо-специфический праймер Az16S-A F / Az16S-A R, позволивший выделить штаммы рода Azospirillum в чистой культуре (3 штамма). Полученные экспериментальные данные по молекулярному маркеру позволяют образцам штаммов, принадлежность которых к данному роду подтверждена ПЦР анализом, служить как положительным, так и отрицательным контролем при дальнейшей работе с бактериями.&#13;
Ключевые слова: ДНК, полимеразно-цепная реакция, праймер, бактерии, Azospirillum</p>
   </trans-abstract>
   <kwd-group xml:lang="ru">
    <kwd>ДНК</kwd>
    <kwd>полимеразно-цепная реакция</kwd>
    <kwd>праймер</kwd>
    <kwd>бактерии</kwd>
    <kwd>Azospirillum</kwd>
   </kwd-group>
  </article-meta>
 </front>
 <body>
  <p></p>
 </body>
 <back>
  <ref-list>
   <ref id="B1">
    <label>1.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Bashan Y., HolguinG., De-Bashan L.Azospirillum-plant relationships: physiological, molecular, agricultural and environmental advances Can J Microbiol, 2004, Vol. 50,pp. 521-577.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Bashan Y., HolguinG., De-Bashan L.Azospirillum-plant relationships: physiological, molecular, agricultural and environmental advances Can J Microbiol, 2004, Vol. 50,pp. 521-577.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B2">
    <label>2.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Braun-Kiewnick A. [et al.]Development of species-, strain- and antibiotic biosynthesis-specific quantitative PCR assays for Pantoea agglomerans as tools for biocontrol monitoring. Journal of Microbiological Methods, 2012, Vol. 90, pp. 315-320.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Braun-Kiewnick A. [et al.]Development of species-, strain- and antibiotic biosynthesis-specific quantitative PCR assays for Pantoea agglomerans as tools for biocontrol monitoring. Journal of Microbiological Methods, 2012, Vol. 90, pp. 315-320.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B3">
    <label>3.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Fukami J., CereziniP., Hungria M. Azospirillum: benefits that go far beyond biological nitrogen fixation. AMB Express, 2018, Vol. 8, pp. 73-85.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Fukami J., CereziniP., Hungria M. Azospirillum: benefits that go far beyond biological nitrogen fixation. AMB Express, 2018, Vol. 8, pp. 73-85.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B4">
    <label>4.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">HusseinA., NalbandyanA. , FedulovaT., BogachevaN.Efficient and nontoxic DNA isolation method for PCR analysis.Russian Agricultural Sciences, May 2014, Vol. 40,Issue 3,pp. 177-178.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">HusseinA., NalbandyanA. , FedulovaT., BogachevaN.Efficient and nontoxic DNA isolation method for PCR analysis.Russian Agricultural Sciences, May 2014, Vol. 40,Issue 3,pp. 177-178.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B5">
    <label>5.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Mahuku G. S. A simple extraction method suitable for PCR-based analysis of plant, fungal, and bacterial DNA Plant Mol. Biol. Rep, 2004, Vol. 22, pp. 71-81.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Mahuku G. S. A simple extraction method suitable for PCR-based analysis of plant, fungal, and bacterial DNA Plant Mol. Biol. Rep, 2004, Vol. 22, pp. 71-81.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B6">
    <label>6.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Rogers S., Bendich A.Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues. Plant Molecular Biologi, 1985, Vol. 5, pp. 67-69.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Rogers S., Bendich A.Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues. Plant Molecular Biologi, 1985, Vol. 5, pp. 67-69.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B7">
    <label>7.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Scarpellini M.,FranzettiL., Galli A. Development of PCR assay to identify Pseudomonas fluorescens and its biotype. FEMS Microbiology Letters, 2004, Vol. 236, pp. 257-260.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Scarpellini M.,FranzettiL., Galli A. Development of PCR assay to identify Pseudomonas fluorescens and its biotype. FEMS Microbiology Letters, 2004, Vol. 236, pp. 257-260.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B8">
    <label>8.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Shime-HattoriA., KobayashiS., IkedaS., Asano R. A rapid and simple PCR method for identifying isolates of the genus Azospirillum within populations of rhizosphere bacteria. Journal of Applied Microbiology, 2011, Vol. 111,pp. 915-924.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Shime-HattoriA., KobayashiS., IkedaS., Asano R. A rapid and simple PCR method for identifying isolates of the genus Azospirillum within populations of rhizosphere bacteria. Journal of Applied Microbiology, 2011, Vol. 111,pp. 915-924.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B9">
    <label>9.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">SpilkerT., CoenyeT., VandammeP., Puma J. Li PCR-Based Assay for Differentiation of Pseudomonas aeru-ginosa from Other Pseudomonas Species Recovered from Cystic Fibrosis Patients. Journal of Clinical Microbiolgy, 2004, Vol. 42,no 5, pp. 2074-2079.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">SpilkerT., CoenyeT., VandammeP., Puma J. Li PCR-Based Assay for Differentiation of Pseudomonas aeru-ginosa from Other Pseudomonas Species Recovered from Cystic Fibrosis Patients. Journal of Clinical Microbiolgy, 2004, Vol. 42,no 5, pp. 2074-2079.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B10">
    <label>10.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">Suaad S. Microbiological and molecular identification of bacterial species isolated from nasal and oropha-ryngeal mucosa of fuel workers in Riyadh, Saudi Arabia. Saudi J of Biological Sciences, 2017, Vol. 24,no 6, pp. 1281-1287.</mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">Suaad S. Microbiological and molecular identification of bacterial species isolated from nasal and oropha-ryngeal mucosa of fuel workers in Riyadh, Saudi Arabia. Saudi J of Biological Sciences, 2017, Vol. 24,no 6, pp. 1281-1287.</mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
  </ref-list>
 </back>
</article>
