Гипоталамическая дисфункция является наиболее распространенной патологией пубертатного периода и у 39% девочек-подростков сопровождается ожирением. Ожирение является одной из основных причин нарушений репродуктивной функции у женщин, ведущих к снижению фертильности. Цель исследования – оценить гинекологическое здоровье женщин репродуктивного возраста с гипоталамической дисфункцией в пубертатном периоде и определить механизмы формирования первичного бесплодия. Проведено проспективное обследование девочек-подростков с ГД (n=170) с 2000 по 2013 годы. Из 170 потенциальных участников, согласно критериям отбора, оценка фертильности проведена у 86 женщин репродуктивного возраста, из них сравнительная характеристика – у фертильных женщин (n=46) и с первичным бесплодием (n=21). У женщин с первичным бесплодием с ГД в пубертатном периоде, в сравнении с фертильными женщинами значимо чаще выявляли СПКЯ (38,1%), отсутствие желтого тела в одном из яичников (71,4%), снижение прогестерона в 2 раза в сыворотке крови, увеличение ERα/PGR в 2,3 раза и активности NF-kВ в 1,4 раза в эндометрии в сравнении с фертильными. Уровень ERα и PGR в эндометрии снижается при увеличение активности NF-kВ и ИМТ. Установлена взаимосвязь активности NF-kВ и ИМТ в обеих исследуемых группах.