РЕКОНСТРУКЦИЯ САЙТОВ РЕКОМБИНАЦИИ В ГЕНОМНЫХ СТРУКТУРАХ ШТАММОВ ГЕНОТИПА 6 ВИРУСА ГЕПАТИТА С
Авторы:
4.
Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека
(Лаборатория молекулярной эпидемиологии и генетической диагностики, лаборант-исследователь)
Иркутск, Иркутская область, Россия
Иркутск, Иркутская область, Россия
8.
Иркутский государственный медицинский университет
(кафедра микробиологии, вирусологии и иммунологии с курсом клинической лабораторной диагностики, Заведующий)
Иркутск, Иркутская область, Россия
Иркутск, Иркутская область, Россия
Тип:
Статья
Страницы:
с 100
по 103
Статус:
Опубликован
Получено:
10.12.2016
Одобрено:
10.12.2016
Опубликовано:
10.12.2016
Язык материала:
русский
Ключевые слова:
вирус гепатита С, генотип 6, программные методы RDP, сайты рекомбинации
Аннотация (русский):
В геномах 46 штаммов генотипа 6 вируса гепатита С посредством комплекса биоинформационных программ RDP выявлены 6 штаммов-рекомбинантов, в которых зафиксированы 7 сайтов рекомбинации. Для них определены родительские штаммы, от которых они могли быть получены. Большая часть сайтов рекомбинации приходится на область структурных генов C, E1 и E2 и неструктурных генов NS5a и NS5b. В одном штамме выявлен уникальный сайт рекомбинации в высоко консервативном гене NS3. По результатам исследования определены «горячие точки» рекомбинации в штаммах генотипа 6 вируса гепатита С.
В геномах 46 штаммов генотипа 6 вируса гепатита С посредством комплекса биоинформационных программ RDP выявлены 6 штаммов-рекомбинантов, в которых зафиксированы 7 сайтов рекомбинации. Для них определены родительские штаммы, от которых они могли быть получены. Большая часть сайтов рекомбинации приходится на область структурных генов C, E1 и E2 и неструктурных генов NS5a и NS5b. В одном штамме выявлен уникальный сайт рекомбинации в высоко консервативном гене NS3. По результатам исследования определены «горячие точки» рекомбинации в штаммах генотипа 6 вируса гепатита С.
Ключевые слова:
вирус гепатита С, генотип 6, программные методы RDP, сайты рекомбинации
вирус гепатита С, генотип 6, программные методы RDP, сайты рекомбинации
1. КалининаО.В. Вирус гепатита С: механизмы изменчивости, классификация, эволюция //Вопросывирусологии. - 2015. - No5. - С.5-10.
2. ЧистяковаМ.В., ГоворинА.В., РадаеваЕ.В., Гон-чароваЕ.В., МорозоваЕ.И. Кардиогемодинамические нарушения у больных с хроническими гепатитами //Сибирский медицинский журнал (Иркутск). - 2012.- No1. - С.51-54.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
9.
10.
11.
12.
13.
14.
