Возбудителями оппортунистических инфекций являются более 100 видов микроорганизмов [1]. Они постоянно циркулируют в конкретном микробиоценозе, а их свойства обусловлены влиянием опреде-лённых факторов внешней среды данного биоценоза [2]. Вирусная инфекция также создаёт благоприятные условия для активизации патогенных и условно-патогенных бактерий и микромицетов [3, 4]. Дисбаланс меж-ду резидентными и транзиторными микроорганизмами выявлен нами ранее у норок и хорьков (фретка) с не-заразной патологией желудочно-кишечного тракта [5, 6]. При этом хеликобактерии являются одним из веду-щих этиологических факторов в развитии незаразной патологии желудочно-кишечного тракта у животных [7]. Коррекцию и профилактику нарушений в микробиоценозе желудочно-кишечного тракта у животных принято, как правило, осуществлять назначением препаратов и кормовых добавок, содержащих определённые группы микроорганизмов [8, 9]. В связи с этим были проведены исследования резидентной и транзиторной микро-флоры желудочно-кишечного тракта морских свинок, содержащихся у жителей Самарской области.Цель исследований – повышение резистентности организма морских свинок к действию патогенных и условно-патогенных микроорганизмов, вызывающих гастроэнтерит.Исходя из цели исследования, были по-ставлены следующие задачи – выделение и идентификация у морских свинок видового состава микрофлоры желудочно-кишечного тракта поморфологическим, тинкториальным, культуральным, биохимическим и серо-логическим свойствам.  Материалы и методы исследований. Материалом и объектом для исследования являлись самки морских свинок, содержащихся в домашних условиях у жителей Самарской области. Были отобраны по средней живой массе тела 5 морских свинок в возрасте около 2,5-3 лет. Морских свинок в течение исследо-вания (октябрь-декабрь 2015 г.) кормили разнотравным сеном, содержащим большое количество пылевых частиц. В ходе исследования морские свинки содержались в клетках со свободным доступом к воде (вакуум-ные поилки) и разнотравному сену.  В начале и в процессе исследования у морских свинок наблюдались при-знаки угнетения, снижения аппетита и температуры тела, умеренная жажда, моторика желудка и перисталь-тика кишечника слабые, при пальпации стенка живота напряжённая, реакция болезненная, у животных сни-жалась живая масса, периодические поносы и частые акты дефекации, кал жидкий с примесями слизи и пло-хопереваренными частицами корма, с примесями крови. По завершении исследования свинки были вынуж-денно убиты, у них в ходе патологоанатомического вскрытия выявлено набухание и гиперемия