Клещевой энцефалит (КЭ) – широко известное вирусное заболевание, которое передается через укусы иксодовых клещей. В тяжелых случаях КЭ приводит к инвалидизации или гибели больного. Возбудителем КЭ является вирус КЭ, относящийся к семейству Flaviviridae. Несмотря на большое значение КЭ в патологии человека, в настоящее время единственным средством профилактики и лечения этого заболевания является донорский иммуноглобулин, который обладает целым рядом существенных недостатков. В данной работе проанализирована современная литература о выявлении противовирусных свойств препаратов растительного происхождения и оценена возможность их использования для поиска новых лекарств против вируса КЭ. Практически все опубликованные работы можно разделить на два направления исследований – изучение цельных экстрактов растений и изучение биологической активности очищенных компонентов экстрактов. При этом второй подход иногда используется в качестве естественного продолжения первого. Наиболее информативные результаты можно получить при выполнении некоторых условий, например, исследуя водные экстракты растений или экстракты, полученные с помощью органических растворителей. При этом необходимо фракционирование исходных препаратов с выявленной противовирусной активностью с последующей концентрацией целевого вещества и идентификация противовирусного агента для получения стандартизованных препаратов с целью проведения доклинических испытаний на лабораторных животных и культурах клеток. Такой подход позволил выявить три вещества – хебулиевую кислоту, пуникалагин и байкалеин, обладающие нейтрализующей активностью в отношении флавивируса Денге. В настоящем сообщении обсуждается оптимальный алгоритм поиска противовирусных средств в растительных препаратах и возможность использования этих веществ против вируса КЭ.