Bulletin Samara State Agricultural Academy Bulletin Samara State Agricultural Academy Известия Самарской государственной сельскохозяйственной академии 1997-3225 11016 10.12737/18327 ВЕТЕРИНАРИЯ И ЗООТЕХНИЯ VETERINARY MEDICINE AND ZOOTECHNICS ВЕТЕРИНАРИЯ И ЗООТЕХНИЯ EVALUATION OF GENETIC PARAMETERS IN HENS USING MICROSATELLITE MARKERS ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ КУР ПРИ ИСПОЛЬЗОВАНИИ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ Новгородова Инна Петровна Novgorodova Inna Petrovna novg-inna2005@yandex.ru

кандидат биологических наук;

candidate of sciences in biology;

 Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства имени академика Л. К. Эрнста The All-Russia Research Institute for Animal Husbandry named after Academy Member L.K. Ernst 15 03 2016 15 03 2016 1 1 41 43 https://naukaru.ru/en/nauka/article/11016/view

Цель исследования– совершенствование процесса идентификации породной принадлежности птиц с ис-пользованием микросателлитных локусов. Исследования проводили на 9 породах кур: австролоп черно-пестрый (АВС_ЧП), австролоп черный (АВС_Ч), куланги (КУЛ), чешская золотистая (ЧЕШ_З), андалузская голубая (АНД_Г), голошейная (ГЛШ), брекель серебристый (БР_С), русская черная бородатая (РУС_ЧБ) и минорка (МИН) (в количестве n=268) по 16-ти маркерам. В каждой опытной группе было 29-30 голов птиц. Исследования были проведены в лабо-ратории молекулярной генетики животных ВИЖа им. Л.К. Эрнста. Разделение и детекцию продуктов амплификации выполняли на генетическом анализаторе АВI3130xl («AppliedBiosystems», США). Статистическую обработку данных проводили с помощью программного обеспечения GenAlEx (v.6.4.). В ходе работы изучено генетическое разнообразие кур (среднее число аллелей, число эффективных аллелей, уровень гомо- и гетерозиготности и т.д.) по микросател-литным локусам. Следует отметить, что среднее число аллелей в проведенном исследовании колебалось от 6,06±0,050 у кур породы АНД_Г до 7,81±0,73 у кур породы ГЛШ, в то время как число информативных аллелей варьи-ровало от 3,63±0,30 у птиц породы АНД_Г до 5,44±0,34 у птиц породы БРЕК_С. В ходе исследований была отмечена высокая информативность 16-ти выбранных локусов и в зависимости от локуса число аллелей колебалось от 8 (ло-кус MCW0037) до 25 аллелей (локус MCW0183). Проведенные исследования позволили выявить наличие приватных аллелей у изучаемых пород кур, которые были обнаружены у птиц 7 пород из 9 с частотой встречаемости от 1,7 до 67,7%. Для более точной оценки изменчивости исследуемых пород птиц определили ожидаемую и наблюдаемую ге-терозиготность, средние значения которых, соответственно, достигали 66,9 и 37,1%. Идентификация породной принадлежности кур к своей популяции, рассчитанная на основании анализа 16-ти микросателлитных маркеров, варьировала от 79,3 до 100,0%. Таким образом, использование микросателлитных локусов в племенной работе кур открывает большие возможности при комплектовании генофондного стада птиц.

The purpose of the study is improvement of pedigree accessory of identification process of poultry with use of microsatellite markers. The analysis was performed with 9 breeds of chickens (n=268) for 16 markers. The studies were performed with the chicken breeds, such as: the Black and White Аustralorp (BWAus), Black Australorp (BAus), Kulangi (Kul), Czech Gold (CzG), Blue Andalusian (BAnd), Naked Neck (NN), Silver Campine (Breukel) (SC), Black Bearded Russian (BBRus), and Minorca (Min). There were 29 to 30 poultry in each experimental group. The researches were carried out at the Molecular Genetics Laboratory, Ernst All-Russia Research Institute of Animal Husbandry. Separation and detection of amplification products were performed on an Applied Biosystems АВI3130xl Genetic Analyzer (USA). Statistical data processing was performed using GenAlEx software version 6.4. The work examined genetic diversity of chickens (average number of alleles, number of effective alleles, the level of homo - and heterozygosity, etc.), using microsatellite loci. It should be noted that the average number of alleles in the study ranged from 6.06±0.050 in the BAnd bantams to 7.81±0.73 in the NN chickens, while the number of informative alleles ranged from 3.63±0.30 in the BAnd bantams to 5.44±0.34 in the SC chickens. High informativeness of 16 selected loci performance was noted during the research; the number of alleles ranged from 8 (locus MCW0037) to 25 alleles (locus MCW0183), depending on the locus. The conducted research allowed us to identify the presence of private alleles in the studied breeds of chickens, which were discovered in poultry within 7 of 9 breeds with frequencies of 1.7 to 67.7%. The expected and observed levels of heterozygosity were calculated to assess the variation of the investigated species more accurately; their mean values reached 66.9 and 37.1%, respectively. Breeds of chickens affiliated to their populations were identified based on analysis of 16 microsatellite markers; the estimates varied from 79.3% to 100.0%. Therefore, the use of microsatellite loci in chicken breeding can give more opportunities to create pedigree poultry flocks within the genetic pool of breeds.

микросателлитные маркеры аллели порода курица генетическое разнообразие microsatellite markers alleles breed chicken genetic diversity

Alipanah, M. Study of Genetic diversity of Dashtiari, Khazak and Zabol chicken using microsatellite markers / M. Alipanah, A. Torkamanzehi, Z. Amiry, F. Rabani // Trakia Journal of Sciences. - 2011. - Vol. 9(2). - P. 76-81. Alipanah, M. Study of Genetic diversity of Dashtiari, Khazak and Zabol chicken using microsatellite markers / M. Alipanah, A. Torkamanzehi, Z. Amiry, F. Rabani // Trakia Journal of Sciences. - 2011. - Vol. 9(2). - P. 76-81. FAO. The State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture // Commission on Genetic Resources for Food and Agriculture. Food and Agriculture Organization of the United Nations. - Rome, 2007. - 510 p. FAO. The State of the World’s Animal Genetic Resources for Food and Agriculture // Commission on Genetic Resources for Food and Agriculture. Food and Agriculture Organization of the United Nations. - Rome, 2007. - 510 p. Hoffmann Global plan of action for animal genetic resources: The global plan of action for animal genetic resources and the conservation of poultry genetic resource // Animal Production and Health Division // World´s Poultry Science Journal. - 2009. - Vol. 65. - P. 286-297. Hoffmann Global plan of action for animal genetic resources: The global plan of action for animal genetic resources and the conservation of poultry genetic resource // Animal Production and Health Division // World´s Poultry Science Journal. - 2009. - Vol. 65. - P. 286-297. Pritchard, J. K. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data / J. K. Pritchard, M. Stephens, P. Donnelly // Genetics. - 2000. - Vol. 155(2). - P. 945-959. Pritchard, J. K. Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data / J. K. Pritchard, M. Stephens, P. Donnelly // Genetics. - 2000. - Vol. 155(2). - P. 945-959. Semik, E. The state of poultry genetic resources and genetic diversity of hen populations / E. Semik, J. Krawczyk // Ann. Anim. Sci. - 2011. - Vol. 11(2). - P. 181-191. Semik, E. The state of poultry genetic resources and genetic diversity of hen populations / E. Semik, J. Krawczyk // Ann. Anim. Sci. - 2011. - Vol. 11(2). - P. 181-191. Yahav, S. Challenges in poultry production during the 21st century // Proceedings of XIV European Poultry Conference. - Stavanger, 2014. - P. 67-77. Yahav, S. Challenges in poultry production during the 21st century // Proceedings of XIV European Poultry Conference. - Stavanger, 2014. - P. 67-77. Zhao, Z.-H. Analysis of Genetic Structure and Diversity of Chai Chicken Breed Using Microsatellite Marker / Z.-H. Zhao, J.-Z. Xi, Q. Jia, S.-F. Li and H.-Y. Huang // J. of Anim. and Veter. Advan. - 2010. - Vol. 9 (8). - P.1197-1200. Zhao, Z.-H. Analysis of Genetic Structure and Diversity of Chai Chicken Breed Using Microsatellite Marker / Z.-H. Zhao, J.-Z. Xi, Q. Jia, S.-F. Li and H.-Y. Huang // J. of Anim. and Veter. Advan. - 2010. - Vol. 9 (8). - P. 1197-1200.