Пептококки и пептострептококки в ассоциации с другими микробами вызывают гнойно-воспали-тельные болезни различной локализации, обитают на слизистых полости рта, кишечника, верхних дыхатель-ных путей и мочеполового тракта. Энтеробактерии вызывают кишечные инфекции и некишечные, оппортунистические инфекции, вы-зываемые условно-патогенными бактериями различных родов семейства Enterobacteriaceae [1]. Вирусная инфекция в период становления клеточных и гуморальных звеньев неспецифической ре-зистентности и иммунной системы создаёт благоприятные условия для активизации патогенных и условно-патогенных бактерий и микромицетов [2, 3]. Условно-патогенные микроорганизмы, представители резидентной и транзиторной микрофлоры макроорганизма оказывают болезнетворное воздействие на организм изученных хорьков, кошек и собак [4, 5]. Питание животных, при этом, является одним из самых значимых экологических антропогенных фак-торов для макроорганизма, который может привести к качественным и количественным нарушениям видово-го спектра микробного ценоза [6]. При дисфункции микробиоценоза у мелких домашних животных часто диагностируются кератомико-зы и поверхностные дерматомикозы [7]. В ходе дисбаланса микробиоценоза желудочно-кишечного тракта у козлят происходит снижение ре-зидентной облигатной анаэробной микрофлоры [8]. В настоящее время в России у граждан большой популярностью пользуются шиншиллы, у которых часто, как и у других грызунов, проявляется незаразная патология желудочно-кишечного тракта [9]. В связи с этим были проведены исследования резидентной и транзиторной микрофлоры шиншилл, содержащихся у жителей г. Самара.Цель исследований – повышение резистентности организма шиншилл к представителям патоген-ных и условно-патогенных микробов при незаразной патологии желудочно-кишечного тракта. Задачи исследований – выделение и идентификация у шиншилл видового состава микрофлоры желудочно-кишечного тракта по морфологическим, тинкториальным, культуральным, биохимическим и серо-логическим свойствам.